d
 
(9 intermediate revisions by 4 users not shown)
Riadok 9: Riadok 9:
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Color mathing problem of industrial paints.
 
   | tema = Color mathing problem of industrial paints.
  | popis = -
+
   | poziadavky = -Zvládnuť matematickú teóriu dynamicky sa meniacich (napr. rastúcich ) sietí, pochopiť merania mozgu pomocou funkčnej magnetickej rezonancie (fmri) a výpovednú hodnotu fmri dát, porozumieť štruktúre mozgu a šírenie signálov v neurónovej sieti mozgu, motivovanosť, chuť bádať v novej oblasti.
   | poziadavky = -
+
  | odporucania = -
+
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Návrh zobrazovacích metód trblietivosti na monitoroch, HDR monitoroch, v tlači.
 
   | tema = Návrh zobrazovacích metód trblietivosti na monitoroch, HDR monitoroch, v tlači.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Návrh analytického BRDF modelu z nameraných hodnôt KONICA spektrofotometrom a z textúr. (Ide o kompresiu množstva nameraných dát do analytickej funkcie dostatočne flexibilnej na reprezentáciu priemyselných meraní)
 
   | tema = Návrh analytického BRDF modelu z nameraných hodnôt KONICA spektrofotometrom a z textúr. (Ide o kompresiu množstva nameraných dát do analytickej funkcie dostatočne flexibilnej na reprezentáciu priemyselných meraní)
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Analytický  model HDR oblohy a model z reálnych nameraných dát v okolí Bratislavy.
 
   | tema = Analytický  model HDR oblohy a model z reálnych nameraných dát v okolí Bratislavy.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
Riadok 39: Riadok 28:
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Animation of water and air erosion due to the floods.
 
   | tema = Animation of water and air erosion due to the floods.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Flood animation and control interface for flood simulator.
 
   | tema = Flood animation and control interface for flood simulator.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
Riadok 55: Riadok 38:
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Projekcie obsahu WWW stánok do audio priestoru, metriky popisujúce kvalitu tohto zobrazenia.
 
   | tema = Projekcie obsahu WWW stánok do audio priestoru, metriky popisujúce kvalitu tohto zobrazenia.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Human computer interaction for shape based animations.
 
   | tema = Human computer interaction for shape based animations.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
Vyberte si tému podľa projektov problémov čo sa Vám páči (bubbles, growth, reconstruction, deformations, fuid dynamics, simulation of natural phenomena, paint rendering) na http://www.sccg.sk/~durikovic.
 
Vyberte si tému podľa projektov problémov čo sa Vám páči (bubbles, growth, reconstruction, deformations, fuid dynamics, simulation of natural phenomena, paint rendering) na http://www.sccg.sk/~durikovic.
 +
 +
=== doc. RNDr. Milan Ftáčnik, CSc. ===
 +
 +
{{Tema
 +
  | tema = Augmented reality in cultural heritage applications.
 +
}}
  
 
=== doc. RNDr. Mária Markošová, CSc. ===
 
=== doc. RNDr. Mária Markošová, CSc. ===
  
 
{{Tema
 
{{Tema
   | tema = Matematické modely rastúcich sietí.
+
   | tema = Hľadanie funkčných sietí mozgu (téma je osadená Zuzana Petráková)
   | popis = Úlohou doktoranta je dobre zvládnuť teóriu sietí a vedieť si poradiť s riešením integro – diferenciálnych rovníc. Zároveň sa očakávajú dobré programátorské schopnosti. Úlohou doktoranta je preštudovať ako je výsledná štruktúra siete ovplyvnená obmedzeniami danými na kapacitu a vek uzlov siete a tiež spôsobom pripájania uzlov. Očakáva sa, že doktorant vytvorí počítačové modely rastúcich sietí, zmeria ich štatistické vlastnosti a vytvorí vhodné matematické modely vo forme integro – diferenciálnych rovníc.<br>'''Literatúra:''' Barabási, Albert , Science (1999) 509; Watts, Small worlds, Princeton Univ. Press, 2004; Albert, Yeong, Barabási, Nature 401 (1999) 130.
+
   | popis = Výskum, ktorý je predmetom dizertačnej práce,  sa bude robiť v spolupráci s Dr Susanne Reiterer z Department of Neuroradiology, University of
   | poziadavky = -
+
Tübingen, Germany, Dr. Liz Franz z Department of Psychology, University of
   | odporucania = -
+
Otago, Dunedin, New Zealand a Doc. Beňuškovou z Department of Computer Science
 +
University of Otago, Dunedin, New Zealand. Všetci spolupracovníci pracujú v,
 +
alebo majú kontakt na  skupiny merajúce fmri dáta mozgu. Dizertačná práca je  
 +
aplikáciou teórie sietí na štúdium mozgu. Cieľom dizertačnej práce je hľadať
 +
tzv. funkčné siete mozgu. Sú to siete, ktoré vyjadrujú vzťahy korelácie medzi
 +
funkčne prepojenými oblasťami mozgu a zmien tejto korelácie pri plnení
 +
rozličných kognitívnych úloh. Pomocou funkčných sietí sa na mozog možno pozerať
 +
novým spôsobom, nie ako na sieť neurónov, ale ako na sieť skupín neurónov,
 +
ktoré, aj keď nie sú spojené fyzicky, spolupracujú pri vykonávaní kognitívnych
 +
úloh. Oblasť výskumu je veľmi aktuálna, prvé výsledky sa objavili len pred
 +
niekoľkými rokmi [4]. Ukazujú, že funkčné siete mozgu sú bezškálové siete a sú
 +
aj sieťami malého sveta [5,6].
 +
Úlohou dizertanta bude:
 +
- spracovať namerané dáta a vytvoriť funkčné siete vznikajúce pri plnení rôznych kognitívnych úloh a funkčné siete mozgu v relaxačnom móde
 +
- zistiť a kompletne vyhodnotiť štatistické vlastnosti nájdených sietí
 +
- porovnať a interpretovať rozdiely funkčných sietí pre kognitívne úlohy
 +
rôznych obťažností (rytmická úloha, počúvanie hudby, opakovanie viet v známom
 +
i neznámom jazyku a podobne)
 +
- zistiť, či existujú  typické rozdiely pre funkčné siete v relaxačnom móde
 +
mozgu a pri plnení kognitívnych úloh
 +
- postaviť matematický model dynamicky sa meniacej siete, ktorý by simuloval
 +
vlastnosti a dynamiku funkčných sietí mozgu
 +
- pokúsiť sa pochopiť ako funkčné siete súvisia s reálnou štruktúrou neurónovej
 +
siete mozgu
 +
- dobré programátorské schopnosti
 +
  |poziadavky = Zvládnuť matematickú teóriu dynamicky sa meniacich (napr. rastúcich) sietí, pochopiť merania mozgu pomocou funkčnej magnetickej
 +
rezonancie (fMRI) a výpovednú hodnotu fMRI dát, porozumieť štruktúre mozgu a
 +
šírenie signálov v neurónovej sieti mozgu, motivovanosť, chuť bádať v novej
 +
oblasti.
 +
  |literatura =
 +
[1] Watts D. J., Small worlds, Princeton University Press, Princeton (2004)
 +
[2] Benuskova, Kasabov, Computational Neurogenetic Modeling, Springer, New
 +
York (2007)
 +
[3] Dorogovtsev, Mendes, Evolution of Networks, Adv. Phys. 51, 1079 (2002)
 +
[4] Chialvo, Critical Brain Networks, Physica A 340 (4) 756 (2004)
 +
[5] Eguíluz, Chialvo, Cecchi, Baliki, Apkarian, Scale free brain functional
 +
networks, Phys. Rev. Letters 92, 018102 (2005)
 +
[6] Markošová, Beňušková, Franz, Topology of brain functional networks: towards
 +
the role of genes, vyjde v Proc. of INNS – NNN Symposia, Springer, New York 2009
 +
}}
 +
 
 +
{{Tema
 +
   | tema = Rozšíriť a optimalizovať zobrazovanie veľkých grafov v NAViGaTOR<br>      '''Tému zadal Ing. Igor Jurisica PhD., University of Toronto 
 +
   | popis = <br>
 +
* Optimalizácia z hľadiska využitia priestoru na obrazovke, z hľadiska rýchlosti zobrazovania,<br>a z biologického hľadiska (napr. Rozmiestnenie proteinov podľa anotácie z GO).
 +
* Reprezentácia hypergrafov
 +
 
 +
  |literatura = [1] Djebbari, A., Ali, M., Otasek, D., Kotlyar. M., Fortney, K., Wong, S., Hrvojic, A. and Jurisica,<br> I. NAViGaTOR: Scalable and Interactive Navigation and Analysis of Large Graphs. Network Mathematics, 2011. In press <br>[2] Viau, C., McGuffin, M J., Chiricota, Y., and Jurisica, I. The FlowVizMenu and parallel scatterplot matrix: Hybrid multidimensional visualizations for network exploration. IEEE Trans Vis Comput Graph, 16(6):1100-8, 2010.<br>
 +
[3] McGuffin, M, and Jurisica, I. Interaction techniques for selecting and manipulating subgraphs in network visualizations. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics (TVCG), 15(6): 937-944, 2009.<br>
 +
[4] Brown, K.R., Otasek, D., Ali, M., McGuffin, M., Xie, W., Devani, B., Van Toch, I. L., Jurisica , I. NAViGaTOR: Network analysis, visualization & graphing Toronto. Bioinformatics, 25(24):3327-9, 2009.<br>
 +
[5] Viaceré články s D. Auber - TopoLayout; C. North – porovnanie automaticky generovných zobrazení s expertami.<br>
 +
[6] http://www.cs.utoronto.ca/navigator
 
}}
 
}}
  
Riadok 82: Riadok 116:
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Hľadanie, vizualizácia a interpretácia patternov/vzorov v DNA sekvenciách (napr. kompletných genómoch).
 
   | tema = Hľadanie, vizualizácia a interpretácia patternov/vzorov v DNA sekvenciách (napr. kompletných genómoch).
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Možnosti systematického vyhľadávania sekundárnych štruktúr ribonukleových kyselín na základe analýzy primárnej štruktúry DNA.
 
   | tema = Možnosti systematického vyhľadávania sekundárnych štruktúr ribonukleových kyselín na základe analýzy primárnej štruktúry DNA.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Tableaux Calculi for Dynamic Logic Programming.
 
   | tema = Tableaux Calculi for Dynamic Logic Programming.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
{{Tema
 
{{Tema
 
   | tema = Prioritized Logic Programming Based on Dependency Framework.
 
   | tema = Prioritized Logic Programming Based on Dependency Framework.
  | popis = -
 
  | poziadavky = -
 
  | odporucania = -
 
 
}}
 
}}
  
 
__NOTOC__
 
__NOTOC__

Aktuálna revízia z 08:18, 18. október 2011

Témy dizertačných prác pre uchádzačov o doktorandské štúdium pre šk. r. 2007/2008

9.2.1 Informatika

doc. RNDr. Roman Ďurikovič, PhD.

Témy projektu APCOCOS:

Téma: Color mathing problem of industrial paints.
Požiadavky: -Zvládnuť matematickú teóriu dynamicky sa meniacich (napr. rastúcich ) sietí, pochopiť merania mozgu pomocou funkčnej magnetickej rezonancie (fmri) a výpovednú hodnotu fmri dát, porozumieť štruktúre mozgu a šírenie signálov v neurónovej sieti mozgu, motivovanosť, chuť bádať v novej oblasti.
Téma: Návrh zobrazovacích metód trblietivosti na monitoroch, HDR monitoroch, v tlači.
Téma: Návrh analytického BRDF modelu z nameraných hodnôt KONICA spektrofotometrom a z textúr. (Ide o kompresiu množstva nameraných dát do analytickej funkcie dostatočne flexibilnej na reprezentáciu priemyselných meraní)
Téma: Analytický model HDR oblohy a model z reálnych nameraných dát v okolí Bratislavy.

Témy projektu Flood:

Téma: Animation of water and air erosion due to the floods.
Téma: Flood animation and control interface for flood simulator.

Témy projektu VIPER:

Téma: Projekcie obsahu WWW stánok do audio priestoru, metriky popisujúce kvalitu tohto zobrazenia.
Téma: Human computer interaction for shape based animations.

Vyberte si tému podľa projektov problémov čo sa Vám páči (bubbles, growth, reconstruction, deformations, fuid dynamics, simulation of natural phenomena, paint rendering) na http://www.sccg.sk/~durikovic.

doc. RNDr. Milan Ftáčnik, CSc.

Téma: Augmented reality in cultural heritage applications.

doc. RNDr. Mária Markošová, CSc.

Téma: Hľadanie funkčných sietí mozgu (téma je osadená Zuzana Petráková)
Popis: Výskum, ktorý je predmetom dizertačnej práce, sa bude robiť v spolupráci s Dr Susanne Reiterer z Department of Neuroradiology, University of

Tübingen, Germany, Dr. Liz Franz z Department of Psychology, University of Otago, Dunedin, New Zealand a Doc. Beňuškovou z Department of Computer Science University of Otago, Dunedin, New Zealand. Všetci spolupracovníci pracujú v, alebo majú kontakt na skupiny merajúce fmri dáta mozgu. Dizertačná práca je aplikáciou teórie sietí na štúdium mozgu. Cieľom dizertačnej práce je hľadať tzv. funkčné siete mozgu. Sú to siete, ktoré vyjadrujú vzťahy korelácie medzi funkčne prepojenými oblasťami mozgu a zmien tejto korelácie pri plnení rozličných kognitívnych úloh. Pomocou funkčných sietí sa na mozog možno pozerať novým spôsobom, nie ako na sieť neurónov, ale ako na sieť skupín neurónov, ktoré, aj keď nie sú spojené fyzicky, spolupracujú pri vykonávaní kognitívnych úloh. Oblasť výskumu je veľmi aktuálna, prvé výsledky sa objavili len pred niekoľkými rokmi [4]. Ukazujú, že funkčné siete mozgu sú bezškálové siete a sú aj sieťami malého sveta [5,6]. Úlohou dizertanta bude: - spracovať namerané dáta a vytvoriť funkčné siete vznikajúce pri plnení rôznych kognitívnych úloh a funkčné siete mozgu v relaxačnom móde - zistiť a kompletne vyhodnotiť štatistické vlastnosti nájdených sietí - porovnať a interpretovať rozdiely funkčných sietí pre kognitívne úlohy rôznych obťažností (rytmická úloha, počúvanie hudby, opakovanie viet v známom i neznámom jazyku a podobne) - zistiť, či existujú typické rozdiely pre funkčné siete v relaxačnom móde mozgu a pri plnení kognitívnych úloh - postaviť matematický model dynamicky sa meniacej siete, ktorý by simuloval vlastnosti a dynamiku funkčných sietí mozgu - pokúsiť sa pochopiť ako funkčné siete súvisia s reálnou štruktúrou neurónovej siete mozgu - dobré programátorské schopnosti

Literatura:

[1] Watts D. J., Small worlds, Princeton University Press, Princeton (2004) [2] Benuskova, Kasabov, Computational Neurogenetic Modeling, Springer, New York (2007) [3] Dorogovtsev, Mendes, Evolution of Networks, Adv. Phys. 51, 1079 (2002) [4] Chialvo, Critical Brain Networks, Physica A 340 (4) 756 (2004) [5] Eguíluz, Chialvo, Cecchi, Baliki, Apkarian, Scale free brain functional networks, Phys. Rev. Letters 92, 018102 (2005) [6] Markošová, Beňušková, Franz, Topology of brain functional networks: towards the role of genes, vyjde v Proc. of INNS – NNN Symposia, Springer, New York 2009

Požiadavky: Zvládnuť matematickú teóriu dynamicky sa meniacich (napr. rastúcich) sietí, pochopiť merania mozgu pomocou funkčnej magnetickej

rezonancie (fMRI) a výpovednú hodnotu fMRI dát, porozumieť štruktúre mozgu a šírenie signálov v neurónovej sieti mozgu, motivovanosť, chuť bádať v novej oblasti.

Téma: Rozšíriť a optimalizovať zobrazovanie veľkých grafov v NAViGaTOR
Tému zadal Ing. Igor Jurisica PhD., University of Toronto
Popis:
  • Optimalizácia z hľadiska využitia priestoru na obrazovke, z hľadiska rýchlosti zobrazovania,
    a z biologického hľadiska (napr. Rozmiestnenie proteinov podľa anotácie z GO).
  • Reprezentácia hypergrafov
Literatura:

[1] Djebbari, A., Ali, M., Otasek, D., Kotlyar. M., Fortney, K., Wong, S., Hrvojic, A. and Jurisica,
I. NAViGaTOR: Scalable and Interactive Navigation and Analysis of Large Graphs. Network Mathematics, 2011. In press
[2] Viau, C., McGuffin, M J., Chiricota, Y., and Jurisica, I. The FlowVizMenu and parallel scatterplot matrix: Hybrid multidimensional visualizations for network exploration. IEEE Trans Vis Comput Graph, 16(6):1100-8, 2010.
[3] McGuffin, M, and Jurisica, I. Interaction techniques for selecting and manipulating subgraphs in network visualizations. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics (TVCG), 15(6): 937-944, 2009.
[4] Brown, K.R., Otasek, D., Ali, M., McGuffin, M., Xie, W., Devani, B., Van Toch, I. L., Jurisica , I. NAViGaTOR: Network analysis, visualization & graphing Toronto. Bioinformatics, 25(24):3327-9, 2009.
[5] Viaceré články s D. Auber - TopoLayout; C. North – porovnanie automaticky generovných zobrazení s expertami.
[6] http://www.cs.utoronto.ca/navigator

doc. PhDr. Ján Šefránek, CSc.

Téma: Hľadanie, vizualizácia a interpretácia patternov/vzorov v DNA sekvenciách (napr. kompletných genómoch).
Téma: Možnosti systematického vyhľadávania sekundárnych štruktúr ribonukleových kyselín na základe analýzy primárnej štruktúry DNA.
Téma: Tableaux Calculi for Dynamic Logic Programming.
Téma: Prioritized Logic Programming Based on Dependency Framework.