Tento experiment vykonal Ernest Rutherford spolu so svojimi spolupracovníkmi Geigerom a Marsdenom. Chcel zisťiť, ako je v atóme rozložený kladný náboj. Predpokladalo sa totiž, že kladný náboj je spojite rozložený po celom objeme atómu a elektróny sa v tejto "kladnej hmote" vznášajú. Rutherford teda vzal rádioaktívny prvok, ktorý mu slúžil ako zdroj alfa čatíc. Týmito časticami nechal ostrelovať tenkú zlatú fóliu, za ňou bolo umiestnené tienidlo, ktoré po dopade alfa častice vydalo záblesk, ktorý sa dal pozorovať. Predpokladal pritom, že malé alfa častice budú cez fóliu z ťažkých atómov zlata prelietavať bezo zmeny smeru alebo len s malou zmenou. Vychádzal pritom z predpokladu, že kladný náboj je rozložený v atóme spojite.
Výsledok experimentu ho prekvapil. Pozoroval totiž, že niektoré alfa častice sa odkláňajú od pôvodného smeru o oveľa väčšie uhly ako predpokladal, dokonca niektoré sa od fólie odrazili smerom dozadu. Po dôkladnej analýze experimentu prišiel na to, že kladný náboj musí byť sústrednený v maličkom priestore v strede atómu, ktorý zaberá iba nepatrnú časť z objemu celého atómu. Objavil teda atómové jadro.
Veľká červená gulička na obrázku je zdroj alfa častíc, žltozelený pásik je zlatá fólia a bledomodrý kruh je tienidlo. Pomocou tlačidla "očakávaný výsledok" si spustíte experiment, ktorý bude prebiehať tak, ako Rutherford predpokladal, že bude bežať. Pomocou tlačidla "skutočný výsledok" sa spustí skutočný priebeh experimentu. Pri ňom si môžete zobraziť aj detail zlatej fólie, ktorý ukazuje prechod alfa častíc zlatou fóliou. V okamihu, keď alfa častica preletí fóliou, zmení na animácii farbu.